Изначально тайно основана в 1911 году, в . В связи с действовавшим тогда параграфом 175, запрещающим гомосексуализм, в первые годы не афишировала свою деятельность. Ко временам Веймарской республики Педерация достигла вершины своего развития, особенно выделялся Берлинский гомосексуалитет, который в те времена был крупнейшим в мире. В 1933 году, после прихода к власти нацистов, все гомосечества Германии были разгромленыи сожжены, все не успевшие покинуть страну [[романобеккерасты]] были казнены, и многие педерасты и простые гомосексуалисты — отправлены в концлагеря (некоторые из них также были казнены). Хотя в 1920-х и начале 1930-х годов многие нацисты были активными гомосексуалистами и гомоиерархами, все же в конце концов верх одержала гомофобная фракция нацистской партии.

Заново основана в 1949 году романобеккерастами из [[Американская Педерация|США]] и [[Швейцарская Педерация|Швейцарии]]. Восстановленная Германская Педерация первоначально включила в себя как ФРГ, так и гомосечества, расположенные на территории Западного Берлина. На , так и тайные гомосечества на территории ГДР с начала 1950. В начале 1970-х годов располагалась в ГДР в процессе разрядки и общей либерализации законодательства и образа жизни была создана административно независимая Восточно-Германская Педерация, влившаяся которая вновь влилась в единую Германскую Педерацию при объединении страныв начале 1990-х годов.

В 2001 году анальные неофашисты Германской Педерации предложили ввести во всех гомосечествах обязательную молитву [[Роман Беккер|Роману Беккеру]]. Это предложение вынесли на гомодискуссии, и их поддержало неожиданно большое количество немецких гомосексуалистов. Несмотря на это, молитвы были строго запрещены Романом Беккером , и в гомосечествах Германии долго проводились лекции о вреде такого культа. Согласно [[гомозание|гомозанию]] Романа Беккера, такой культ отвлекает гомосексуалистов от того, что действительно нужно [[Гомос]]у и самому Роману Беккеру — соблюдения [[пять столпов гомосексуализма|Пяти столпов гомосексуализма]], а практикующие его гомосексуалисты подвергаются [[избиение|избиению]]. Вместе с тем Роман Беккер подчеркнул, что речь в гомозании идёт лишь об организованном поклонении, и никто не запрещает гомосексуалистам мысленно обращаться к Гомосу или Роману Беккеру в трудные или, напротив, радостные моменты жизни.